Für den Verein „Naturheilpraxis ohne Grenzen“ schnürt Pflüger Medikamentenpakete, die bedürftigen Menschen zugutekommen. Die gemeinnützige Organisation aus Heilpraktikern, Osteopathen und psychologischen Beratern betreibt ehrenamtlich eine mobile Praxis in Essen. Menschen, die unterhalb des Existenzminimums leben oder sogar obdachlos sind, können sich hier einmal in der Woche für zwei Stunden kostenlos behandeln lassen.

Seit 35 Jahren fördert Pflüger mit einer Mitgliedschaft beim Weißen Ring die Arbeit der größten deutschen Hilfsorganisation für Opfer von Kriminalität. Der Weiße Ring setzt sich als Dialogpartner der Politik für die Durchsetzung berechtigter Opferinteressen ein. Durch dieses Engagement konnte in den vier Jahrzehnten seit Gründung des Vereins die rechtliche und soziale Lage von Kriminalitätsopfern wesentlich verbessert werden.

Das Homöopathische Laboratorium Alexander Pflüger GmbH & Co. KG unterstützt die Hilfsorganisation Apotheker ohne Grenzen Deutschland e.V. (AoG). Denn beide Partner verbindet die Idee, Menschen weltweit mit pharmazeutischer Kompetenz ein Leben in Gesundheit zu ermöglichen. Um die Arbeit der Hilfsorganisation finanziell zu fördern, fließen Erlöse aus dem Verkauf verschiedener Schüßler-Salze-Kombinationen an den gemeinnützigen Verein, die z. B. für die Gesundheitsbildung in Mexiko verwendet werden.